باحث أنماط التسلسل
حدد الأنماط الحرفية أو متعددة الاحتمالات المتداخلة في FASTA DNA أو RNA، مع قواعد صريحة للأشرطة والمطابقة.
يبحث في كل سجل FASTA دون تمييز حالة الأحرف، ويشمل التطابقات المتداخلة. يقارن الوضع الحرفي الرموز تمامًا. يتطلب وضع التطابق الممكن تقاطع مجموعات قواعد IUPAC عند كل موضع. يتطلب وضع التطابق المؤكد أن يسمح النمط بكل قاعدة محتملة في التسلسل. يبحث وضع الشريطين أيضًا عن المتممة العكسية للنمط، ويعرض الإحداثيات على التسلسل الأمامي الأصلي. قد تنتج الأنماط المتناظرة سطرين لشريطين مختلفين عند الموضع نفسه. تبدأ الإحداثيات من واحد وتشمل الطرفين. يُدعم فقط DNA أو RNA الخطي الخالي من الفجوات؛ وهذا ليس تحليلًا للمحاذاة أو التماثل أو المتغيرات أو الدلالة البيولوجية. يعمل محليًا دون رفع بيانات أو استعلام قواعد بيانات. الحدود: 500000 محرف إدخال إجمالًا، و2000 سجل، و2000 مشكلة تحقق، ونمط بطول 1000 رمز، و20000 تطابق، و10000000 مقارنة رموز. يؤدي تجاوز أي حد إلى رفض التقرير كاملًا. يقتصر كل تصدير على 3000000 محرف؛ ويسمح CSV محدد الأنواع بـ200000 قيمة. تعرض المعاينة 200 صف. تتوقف المعالجة بعد 10 ثوانٍ. حتى 500,000 حرف. راجع الإعدادات قبل التشغيل.
نتيجتك
باحث أنماط التسلسل
- ألصق FASTA DNA أو RNA خاليًا من الفجوات وأدخل نمط IUPAC.
- اختر المطابقة الحرفية أو الممكنة أو المؤكدة، وشريطًا واحدًا أو الشريطين.
- راجع الإحداثيات على التسلسل الأمامي الأصلي مع شمول الطرفين، ونزّل جميع التطابقات.
ما تحتاج إلى معرفته
يبحث في كل سجل FASTA دون تمييز حالة الأحرف، ويشمل التطابقات المتداخلة. يقارن الوضع الحرفي الرموز تمامًا. يتطلب وضع التطابق الممكن تقاطع مجموعات قواعد IUPAC عند كل موضع. يتطلب وضع التطابق المؤكد أن يسمح النمط بكل قاعدة محتملة في التسلسل. يبحث وضع الشريطين أيضًا عن المتممة العكسية للنمط، ويعرض الإحداثيات على التسلسل الأمامي الأصلي. قد تنتج الأنماط المتناظرة سطرين لشريطين مختلفين عند الموضع نفسه. تبدأ الإحداثيات من واحد وتشمل الطرفين. يُدعم فقط DNA أو RNA الخطي الخالي من الفجوات؛ وهذا ليس تحليلًا للمحاذاة أو التماثل أو المتغيرات أو الدلالة البيولوجية. يعمل محليًا دون رفع بيانات أو استعلام قواعد بيانات. الحدود: 500000 محرف إدخال إجمالًا، و2000 سجل، و2000 مشكلة تحقق، ونمط بطول 1000 رمز، و20000 تطابق، و10000000 مقارنة رموز. يؤدي تجاوز أي حد إلى رفض التقرير كاملًا. يقتصر كل تصدير على 3000000 محرف؛ ويسمح CSV محدد الأنواع بـ200000 قيمة. تعرض المعاينة 200 صف. تتوقف المعالجة بعد 10 ثوانٍ.