Công cụ tìm mẫu chuỗi
Tìm mẫu nguyên dạng hoặc mã mơ hồ chồng lấn trong DNA hoặc RNA FASTA với quy tắc mạch và khớp rõ ràng.
Tìm trong mọi bản ghi FASTA không phân biệt hoa/thường và gồm kết quả chồng lấn. Chế độ nguyên dạng so ký hiệu chính xác. Chế độ có thể yêu cầu tập bazơ IUPAC giao nhau tại mỗi vị trí. Chế độ chắc chắn yêu cầu mẫu cho phép mọi bazơ có thể của chuỗi. Chế độ hai mạch tìm cả bổ sung đảo ngược của mẫu và báo tọa độ trên chuỗi xuôi gốc. Mẫu đối xứng có thể tạo hai dòng theo mạch ở cùng vị trí. Tọa độ bắt đầu từ một, gồm hai đầu. Chỉ DNA hoặc RNA tuyến tính không khoảng trống; không phân tích căn chỉnh, tương đồng, biến thể hay ý nghĩa sinh học. Chạy cục bộ không tải lên hay tra cơ sở dữ liệu. Giới hạn: tổng 500000 ký tự đầu vào, 2000 bản ghi, 2000 lỗi kiểm tra, mẫu 1000 ký hiệu, 20000 kết quả và 10000000 lần so ký hiệu. Vượt giới hạn từ chối toàn bộ báo cáo. Mỗi bản xuất tối đa 3000000 ký tự; CSV có kiểu tối đa 200000 giá trị. Xem trước 200 dòng. Dừng xử lý sau 10 giây. Tối đa 500.000 ký tự. Kiểm tra cài đặt trước khi chạy.
Kết quả của bạn
Công cụ tìm mẫu chuỗi
- Dán DNA hoặc RNA FASTA không khoảng trống và nhập mẫu IUPAC.
- Chọn khớp nguyên dạng, có thể hoặc chắc chắn và một hoặc hai mạch.
- Xem tọa độ gồm hai đầu trên nguồn xuôi và tải mọi kết quả khớp.
Điều cần biết
Tìm trong mọi bản ghi FASTA không phân biệt hoa/thường và gồm kết quả chồng lấn. Chế độ nguyên dạng so ký hiệu chính xác. Chế độ có thể yêu cầu tập bazơ IUPAC giao nhau tại mỗi vị trí. Chế độ chắc chắn yêu cầu mẫu cho phép mọi bazơ có thể của chuỗi. Chế độ hai mạch tìm cả bổ sung đảo ngược của mẫu và báo tọa độ trên chuỗi xuôi gốc. Mẫu đối xứng có thể tạo hai dòng theo mạch ở cùng vị trí. Tọa độ bắt đầu từ một, gồm hai đầu. Chỉ DNA hoặc RNA tuyến tính không khoảng trống; không phân tích căn chỉnh, tương đồng, biến thể hay ý nghĩa sinh học. Chạy cục bộ không tải lên hay tra cơ sở dữ liệu. Giới hạn: tổng 500000 ký tự đầu vào, 2000 bản ghi, 2000 lỗi kiểm tra, mẫu 1000 ký hiệu, 20000 kết quả và 10000000 lần so ký hiệu. Vượt giới hạn từ chối toàn bộ báo cáo. Mỗi bản xuất tối đa 3000000 ký tự; CSV có kiểu tối đa 200000 giá trị. Xem trước 200 dòng. Dừng xử lý sau 10 giây.