序列基序查找器
按明確的鏈和匹配規則，在 DNA 或 RNA FASTA 中查找重疊的字面或簡併編碼基序。
不區分大小寫地搜索每條 FASTA 記錄，幷包含重疊匹配。字面模式精確比較符號。可能模式要求每個位置的 IUPAC 鹼基集合有交集。確定模式要求序列的每一種可能鹼基都被基序允許。雙鏈模式還搜索基序的反向互補序列，並報告原始正向序列上的座標。迴文基序可能在同一位置產生兩條分別對應不同鏈的結果。座標從一開始且包含兩端。僅支持線性、無缺口的 DNA 或 RNA；這不是比對、同源性、變異或生物學意義分析。 在本地運行，無需上傳或查詢數據庫。限制：輸入共 500000 個字符、2000 條記錄、2000 個驗證問題、1000 個符號的基序、20000 個匹配和 10000000 次符號比較。超出任一限制會拒絕整個報告。每個導出限 3000000 個字符；帶類型的 CSV 允許 200000 個值。預覽顯示 200 行。處理在 10 秒後停止。 最多 500,000 個字元。 執行前請檢查設定。
處理結果
序列基序查找器
- 粘貼無缺口的 DNA 或 RNA FASTA，並輸入 IUPAC 基序。
- 選擇字面、可能或確定匹配，以及單鏈或雙鏈。
- 檢查原始正向序列上包含兩端的座標，並下載所有匹配。
使用須知
不區分大小寫地搜索每條 FASTA 記錄，幷包含重疊匹配。字面模式精確比較符號。可能模式要求每個位置的 IUPAC 鹼基集合有交集。確定模式要求序列的每一種可能鹼基都被基序允許。雙鏈模式還搜索基序的反向互補序列，並報告原始正向序列上的座標。迴文基序可能在同一位置產生兩條分別對應不同鏈的結果。座標從一開始且包含兩端。僅支持線性、無缺口的 DNA 或 RNA；這不是比對、同源性、變異或生物學意義分析。 在本地運行，無需上傳或查詢數據庫。限制：輸入共 500000 個字符、2000 條記錄、2000 個驗證問題、1000 個符號的基序、20000 個匹配和 10000000 次符號比較。超出任一限制會拒絕整個報告。每個導出限 3000000 個字符；帶類型的 CSV 允許 200000 個值。預覽顯示 200 行。處理在 10 秒後停止。