Pesquisa de motivos de sequência
Localize motivos literais ou ambíguos sobrepostos em FASTA DNA ou RNA com regras explícitas de cadeia e correspondência.
Pesquisa todos os registos FASTA sem distinguir maiúsculas e inclui correspondências sobrepostas. O modo literal compara símbolos exatos. O modo possível exige interseção dos conjuntos de bases IUPAC em cada posição. O modo certo exige que o motivo permita todas as bases possíveis da sequência. O modo de ambas as cadeias pesquisa também o complemento inverso do motivo e indica coordenadas na sequência original direta. Motivos palindrómicos podem gerar duas linhas de cadeias distintas na mesma posição. Coordenadas inclusivas a partir de um. Apenas DNA ou RNA linear sem lacunas; não analisa alinhamento, homologia, variantes ou significado biológico. Executado localmente sem carregamentos nem pesquisas em bases de dados. Limites: 500000 carateres combinados, 2000 registos, 2000 problemas, motivo com 1000 símbolos, 20000 correspondências e 10000000 comparações. Exceder um limite rejeita o relatório completo. Cada exportação permite 3000000 carateres; CSV tipado 200000 valores. Pré-visualização de 200 linhas. Para após 10 segundos. Até 500 000 caracteres. Reveja as definições antes de executar.
Seu resultado
Pesquisa de motivos de sequência
- Cole FASTA DNA ou RNA sem lacunas e introduza um motivo IUPAC.
- Escolha correspondência literal, possível ou certa e uma ou ambas as cadeias.
- Reveja coordenadas inclusivas na fonte direta e descarregue todas as correspondências.
O que esperar
Pesquisa todos os registos FASTA sem distinguir maiúsculas e inclui correspondências sobrepostas. O modo literal compara símbolos exatos. O modo possível exige interseção dos conjuntos de bases IUPAC em cada posição. O modo certo exige que o motivo permita todas as bases possíveis da sequência. O modo de ambas as cadeias pesquisa também o complemento inverso do motivo e indica coordenadas na sequência original direta. Motivos palindrómicos podem gerar duas linhas de cadeias distintas na mesma posição. Coordenadas inclusivas a partir de um. Apenas DNA ou RNA linear sem lacunas; não analisa alinhamento, homologia, variantes ou significado biológico. Executado localmente sem carregamentos nem pesquisas em bases de dados. Limites: 500000 carateres combinados, 2000 registos, 2000 problemas, motivo com 1000 símbolos, 20000 correspondências e 10000000 comparações. Exceder um limite rejeita o relatório completo. Cada exportação permite 3000000 carateres; CSV tipado 200000 valores. Pré-visualização de 200 linhas. Para após 10 segundos.