مدقق FASTA
اعثر على سجلات FASTA غير السليمة ورموز DNA أو RNA أو البروتين غير المسموح بها، مع تحديد السطر والعمود.
يفحص ملف FASTA وفق قواعد صارمة: سطر رأس واحد يبدأ بالرمز >، ومعرّف فريد في الكلمة الأولى، وتسلسل غير فارغ لكل سجل. يستخدم DNA وRNA مجموعتين منفصلتين من رموز IUPAC. تُقبل الأحماض الأمينية القياسية للبروتينات إضافة إلى B وX وZ وJ وU وO و*. تُقبل الأحرف الصغيرة. تُتجاهل الأسطر الفارغة؛ وتُبلّغ المسافات داخل التسلسل والأرقام والتعليقات وخلط T/U والرموز غير المدعومة مع تحديد السطر والعمود. تُمثّل الفجوات الاختيارية بالرمز -. هذا فحص للتنسيق، وليس لمتطلبات الإيداع في GenBank أو للجودة البيولوجية. يعمل محليًا دون رفع بيانات أو استعلام قواعد بيانات. الحدود: 500000 محرف إدخال إجمالًا، و2000 سجل، و2000 مشكلة تحقق، ونمط بطول 1000 رمز، و20000 تطابق، و10000000 مقارنة رموز. يؤدي تجاوز أي حد إلى رفض التقرير كاملًا. يقتصر كل تصدير على 3000000 محرف؛ ويسمح CSV محدد الأنواع بـ200000 قيمة. تعرض المعاينة 200 صف. تتوقف المعالجة بعد 10 ثوانٍ. حتى 500,000 حرف. راجع الإعدادات قبل التشغيل.
نتيجتك
مدقق FASTA
- ألصق سجلات FASTA واختر DNA أو RNA أو البروتين.
- فعّل فجوات المحاذاة الحرفية فقط إذا كانت موجودة في الإدخال.
- راجع كل مشكلة ونزّل تقرير التشخيص الكامل.
ما تحتاج إلى معرفته
يفحص ملف FASTA وفق قواعد صارمة: سطر رأس واحد يبدأ بالرمز >، ومعرّف فريد في الكلمة الأولى، وتسلسل غير فارغ لكل سجل. يستخدم DNA وRNA مجموعتين منفصلتين من رموز IUPAC. تُقبل الأحماض الأمينية القياسية للبروتينات إضافة إلى B وX وZ وJ وU وO و*. تُقبل الأحرف الصغيرة. تُتجاهل الأسطر الفارغة؛ وتُبلّغ المسافات داخل التسلسل والأرقام والتعليقات وخلط T/U والرموز غير المدعومة مع تحديد السطر والعمود. تُمثّل الفجوات الاختيارية بالرمز -. هذا فحص للتنسيق، وليس لمتطلبات الإيداع في GenBank أو للجودة البيولوجية. يعمل محليًا دون رفع بيانات أو استعلام قواعد بيانات. الحدود: 500000 محرف إدخال إجمالًا، و2000 سجل، و2000 مشكلة تحقق، ونمط بطول 1000 رمز، و20000 تطابق، و10000000 مقارنة رموز. يؤدي تجاوز أي حد إلى رفض التقرير كاملًا. يقتصر كل تصدير على 3000000 محرف؛ ويسمح CSV محدد الأنواع بـ200000 قيمة. تعرض المعاينة 200 صف. تتوقف المعالجة بعد 10 ثوانٍ.