เครื่องมือค้นโมทีฟลำดับ
ค้นโมทีฟตรงตัวหรือรหัสกำกวมที่ซ้อนทับใน DNA หรือ RNA FASTA โดยมีกฎสายและการจับคู่ชัดเจน
ค้นทุกระเบียน FASTA โดยไม่แยกตัวพิมพ์และรวมผลซ้อนทับ โหมดตรงตัวเทียบสัญลักษณ์ตรงกัน โหมดเป็นไปได้ต้องมีสมาชิกชุดเบส IUPAC ร่วมกันทุกตำแหน่ง โหมดแน่นอนกำหนดให้โมทีฟยอมรับเบสที่เป็นไปได้ทั้งหมดของลำดับ โหมดสองสายค้นคู่สมกลับทิศของโมทีฟด้วยและรายงานพิกัดบนลำดับไปข้างหน้าต้นฉบับ โมทีฟพาลินโดรมอาจให้สองแถวแยกสายที่ตำแหน่งเดียว พิกัดเริ่มหนึ่งและรวมปลาย รองรับเฉพาะ DNA หรือ RNA เส้นตรงไม่มีช่อง ไม่ใช่การจัดเรียง ความเหมือน วิเคราะห์ตัวแปร หรือความสำคัญชีวภาพ ทำงานบนเครื่องโดยไม่อัปโหลดหรือค้นฐานข้อมูล จำกัดข้อมูลรวม 500000 อักขระ 2000 ระเบียน 2000 ปัญหาตรวจสอบ โมทีฟ 1000 สัญลักษณ์ 20000 ผลตรง และ 10000000 การเทียบสัญลักษณ์ เกินขีดจำกัดจะปฏิเสธทั้งรายงาน แต่ละไฟล์ส่งออกไม่เกิน 3000000 อักขระ CSV ระบุชนิดได้ 200000 ค่า ตัวอย่าง 200 แถว หยุดประมวลผลหลัง 10 วินาที สูงสุด 500,000 ตัวอักษร ตรวจสอบการตั้งค่าก่อนเริ่มประมวลผล
ผลลัพธ์ของคุณ
เครื่องมือค้นโมทีฟลำดับ
- วาง DNA หรือ RNA FASTA ไม่มีช่อง แล้วกรอกโมทีฟ IUPAC
- เลือกจับคู่ตรงตัว เป็นไปได้ หรือแน่นอน และหนึ่งหรือสองสาย
- ตรวจพิกัดรวมปลายบนแหล่งไปข้างหน้า แล้วดาวน์โหลดทุกผลตรง
สิ่งที่ควรทราบ
ค้นทุกระเบียน FASTA โดยไม่แยกตัวพิมพ์และรวมผลซ้อนทับ โหมดตรงตัวเทียบสัญลักษณ์ตรงกัน โหมดเป็นไปได้ต้องมีสมาชิกชุดเบส IUPAC ร่วมกันทุกตำแหน่ง โหมดแน่นอนกำหนดให้โมทีฟยอมรับเบสที่เป็นไปได้ทั้งหมดของลำดับ โหมดสองสายค้นคู่สมกลับทิศของโมทีฟด้วยและรายงานพิกัดบนลำดับไปข้างหน้าต้นฉบับ โมทีฟพาลินโดรมอาจให้สองแถวแยกสายที่ตำแหน่งเดียว พิกัดเริ่มหนึ่งและรวมปลาย รองรับเฉพาะ DNA หรือ RNA เส้นตรงไม่มีช่อง ไม่ใช่การจัดเรียง ความเหมือน วิเคราะห์ตัวแปร หรือความสำคัญชีวภาพ ทำงานบนเครื่องโดยไม่อัปโหลดหรือค้นฐานข้อมูล จำกัดข้อมูลรวม 500000 อักขระ 2000 ระเบียน 2000 ปัญหาตรวจสอบ โมทีฟ 1000 สัญลักษณ์ 20000 ผลตรง และ 10000000 การเทียบสัญลักษณ์ เกินขีดจำกัดจะปฏิเสธทั้งรายงาน แต่ละไฟล์ส่งออกไม่เกิน 3000000 อักขระ CSV ระบุชนิดได้ 200000 ค่า ตัวอย่าง 200 แถว หยุดประมวลผลหลัง 10 วินาที