Pencari motif sekuens
Temukan motif literal atau berkode ambiguitas yang tumpang tindih dalam DNA atau RNA FASTA, dengan aturan untai dan pencocokan eksplisit.
Mencari setiap rekaman FASTA tanpa membedakan kapitalisasi dan menyertakan kecocokan tumpang tindih. Mode literal membandingkan simbol persis. Mode mungkin mensyaratkan irisan himpunan basa IUPAC pada setiap posisi. Mode pasti mensyaratkan motif mengizinkan semua basa sekuens yang mungkin. Kedua untai juga mencari komplemen balik motif dan melaporkan koordinat pada sekuens maju asli. Motif palindrom dapat menghasilkan dua baris untai pada satu posisi. Koordinat berbasis satu dan inklusif. Hanya DNA atau RNA linear tanpa celah; bukan analisis penyelarasan, homologi, varian atau signifikansi biologis. Berjalan lokal tanpa unggahan atau pencarian basis data. Batas: 500000 karakter masukan gabungan, 2000 rekaman, 2000 masalah validasi, motif 1000 simbol, 20000 kecocokan dan 10000000 perbandingan simbol. Pelampauan menolak seluruh laporan. Setiap ekspor maksimal 3000000 karakter; CSV bertipe maksimal 200000 nilai. Pratinjau 200 baris. Pemrosesan berhenti setelah 10 detik. Maksimal 500.000 karakter. Tinjau pengaturan sebelum menjalankan.
Hasil Anda
Pencari motif sekuens
- Tempel DNA atau RNA FASTA tanpa celah dan masukkan motif IUPAC.
- Pilih pencocokan literal, mungkin atau pasti, serta satu atau kedua untai.
- Tinjau koordinat inklusif pada sumber maju dan unduh semua kecocokan.
Yang perlu diketahui
Mencari setiap rekaman FASTA tanpa membedakan kapitalisasi dan menyertakan kecocokan tumpang tindih. Mode literal membandingkan simbol persis. Mode mungkin mensyaratkan irisan himpunan basa IUPAC pada setiap posisi. Mode pasti mensyaratkan motif mengizinkan semua basa sekuens yang mungkin. Kedua untai juga mencari komplemen balik motif dan melaporkan koordinat pada sekuens maju asli. Motif palindrom dapat menghasilkan dua baris untai pada satu posisi. Koordinat berbasis satu dan inklusif. Hanya DNA atau RNA linear tanpa celah; bukan analisis penyelarasan, homologi, varian atau signifikansi biologis. Berjalan lokal tanpa unggahan atau pencarian basis data. Batas: 500000 karakter masukan gabungan, 2000 rekaman, 2000 masalah validasi, motif 1000 simbol, 20000 kecocokan dan 10000000 perbandingan simbol. Pelampauan menolak seluruh laporan. Setiap ekspor maksimal 3000000 karakter; CSV bertipe maksimal 200000 nilai. Pratinjau 200 baris. Pemrosesan berhenti setelah 10 detik.