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Buscador de motivos de secuencia

Localiza motivos literales o ambiguos solapados en FASTA DNA o RNA con reglas explícitas de hebra y coincidencia.

Busca en todos los registros FASTA sin distinguir mayúsculas y conserva coincidencias solapadas. El modo literal compara símbolos exactos. El modo posible exige intersección de conjuntos IUPAC en cada posición. El modo seguro exige que el motivo permita todas las bases posibles de la secuencia. Ambas hebras busca también el complemento inverso del motivo e informa coordenadas de la secuencia original directa. Los motivos palindrómicos pueden producir dos filas de hebras distintas en una posición. Coordenadas inclusivas desde uno. Solo DNA o RNA lineal sin huecos; no analiza alineamiento, homología, variantes ni significación biológica. Se ejecuta localmente sin cargas ni consultas a bases de datos. Límites: 500000 caracteres combinados, 2000 registros, 2000 problemas de validación, motivo de 1000 símbolos, 20000 coincidencias y 10000000 comparaciones. Superar un límite rechaza el informe completo. Cada exportación admite 3000000 caracteres; CSV tipado 200000 valores. Vista previa de 200 filas. Se detiene tras 10 segundos. Hasta 500.000 caracteres. Revisa los ajustes antes de ejecutar.

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Buscador de motivos de secuencia
  1. Pega FASTA DNA o RNA sin huecos e introduce un motivo IUPAC.
  2. Elige coincidencia literal, posible o segura y una o ambas hebras.
  3. Revisa coordenadas inclusivas sobre la fuente directa y descarga todas las coincidencias.

Qué puedes esperar

Busca en todos los registros FASTA sin distinguir mayúsculas y conserva coincidencias solapadas. El modo literal compara símbolos exactos. El modo posible exige intersección de conjuntos IUPAC en cada posición. El modo seguro exige que el motivo permita todas las bases posibles de la secuencia. Ambas hebras busca también el complemento inverso del motivo e informa coordenadas de la secuencia original directa. Los motivos palindrómicos pueden producir dos filas de hebras distintas en una posición. Coordenadas inclusivas desde uno. Solo DNA o RNA lineal sin huecos; no analiza alineamiento, homología, variantes ni significación biológica. Se ejecuta localmente sin cargas ni consultas a bases de datos. Límites: 500000 caracteres combinados, 2000 registros, 2000 problemas de validación, motivo de 1000 símbolos, 20000 coincidencias y 10000000 comparaciones. Superar un límite rechaza el informe completo. Cada exportación admite 3000000 caracteres; CSV tipado 200000 valores. Vista previa de 200 filas. Se detiene tras 10 segundos.

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