序列基序查找器
按明确的链和匹配规则，在 DNA 或 RNA FASTA 中查找重叠的字面或简并编码基序。
不区分大小写地搜索每条 FASTA 记录，并包含重叠匹配。字面模式精确比较符号。可能模式要求每个位置的 IUPAC 碱基集合有交集。确定模式要求序列的每一种可能碱基都被基序允许。双链模式还搜索基序的反向互补序列，并报告原始正向序列上的坐标。回文基序可能在同一位置产生两条分别对应不同链的结果。坐标从一开始且包含两端。仅支持线性、无缺口的 DNA 或 RNA；这不是比对、同源性、变异或生物学意义分析。 在本地运行，无需上传或查询数据库。限制：输入共 500000 个字符、2000 条记录、2000 个验证问题、1000 个符号的基序、20000 个匹配和 10000000 次符号比较。超出任一限制会拒绝整个报告。每个导出限 3000000 个字符；带类型的 CSV 允许 200000 个值。预览显示 200 行。处理在 10 秒后停止。 最多 500,000 个字符。 运行前请检查设置。
处理结果
序列基序查找器
- 粘贴无缺口的 DNA 或 RNA FASTA，并输入 IUPAC 基序。
- 选择字面、可能或确定匹配，以及单链或双链。
- 检查原始正向序列上包含两端的坐标，并下载所有匹配。
使用须知
不区分大小写地搜索每条 FASTA 记录，并包含重叠匹配。字面模式精确比较符号。可能模式要求每个位置的 IUPAC 碱基集合有交集。确定模式要求序列的每一种可能碱基都被基序允许。双链模式还搜索基序的反向互补序列，并报告原始正向序列上的坐标。回文基序可能在同一位置产生两条分别对应不同链的结果。坐标从一开始且包含两端。仅支持线性、无缺口的 DNA 或 RNA；这不是比对、同源性、变异或生物学意义分析。 在本地运行，无需上传或查询数据库。限制：输入共 500000 个字符、2000 条记录、2000 个验证问题、1000 个符号的基序、20000 个匹配和 10000000 次符号比较。超出任一限制会拒绝整个报告。每个导出限 3000000 个字符；带类型的 CSV 允许 200000 个值。预览显示 200 行。处理在 10 秒后停止。