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FASTA 驗證器

通過行列診斷查找格式錯誤的 FASTA 記錄及無效的 DNA、RNA 或蛋白質符號。

檢查嚴格的 FASTA 格式:每條記錄須有以 > 開頭的一行標頭、唯一的首個詞元標識符和非空序列。DNA 與 RNA 使用各自的 IUPAC 字母表。蛋白質允許標準氨基酸以及 B、X、Z、J、U、O 和 *。允許小寫。忽略空行;序列中的空白、數字、註釋、混用的 T/U 和不支持的符號會連同行列位置一起報告。可選缺口使用字面字符 -。這是格式驗證,不是 GenBank 提交要求檢查或生物學質量評估。 在本地運行,無需上傳或查詢數據庫。限制:輸入共 500000 個字符、2000 條記錄、2000 個驗證問題、1000 個符號的基序、20000 個匹配和 10000000 次符號比較。超出任一限制會拒絕整個報告。每個導出限 3000000 個字符;帶類型的 CSV 允許 200000 個值。預覽顯示 200 行。處理在 10 秒後停止。 最多 500,000 個字元。 執行前請檢查設定。

處理結果

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FASTA 驗證器
  1. 粘貼 FASTA 記錄,選擇 DNA、RNA 或蛋白質。
  2. 僅當輸入使用比對缺口時,才啓用字面缺口。
  3. 檢查每個問題並下載完整診斷報告。

使用須知

檢查嚴格的 FASTA 格式:每條記錄須有以 > 開頭的一行標頭、唯一的首個詞元標識符和非空序列。DNA 與 RNA 使用各自的 IUPAC 字母表。蛋白質允許標準氨基酸以及 B、X、Z、J、U、O 和 *。允許小寫。忽略空行;序列中的空白、數字、註釋、混用的 T/U 和不支持的符號會連同行列位置一起報告。可選缺口使用字面字符 -。這是格式驗證,不是 GenBank 提交要求檢查或生物學質量評估。 在本地運行,無需上傳或查詢數據庫。限制:輸入共 500000 個字符、2000 條記錄、2000 個驗證問題、1000 個符號的基序、20000 個匹配和 10000000 次符號比較。超出任一限制會拒絕整個報告。每個導出限 3000000 個字符;帶類型的 CSV 允許 200000 個值。預覽顯示 200 行。處理在 10 秒後停止。

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