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FASTA 验证器

通过行列诊断查找格式错误的 FASTA 记录及无效的 DNA、RNA 或蛋白质符号。

检查严格的 FASTA 格式:每条记录须有以 > 开头的一行标头、唯一的首个词元标识符和非空序列。DNA 与 RNA 使用各自的 IUPAC 字母表。蛋白质允许标准氨基酸以及 B、X、Z、J、U、O 和 *。允许小写。忽略空行;序列中的空白、数字、注释、混用的 T/U 和不支持的符号会连同行列位置一起报告。可选缺口使用字面字符 -。这是格式验证,不是 GenBank 提交要求检查或生物学质量评估。 在本地运行,无需上传或查询数据库。限制:输入共 500000 个字符、2000 条记录、2000 个验证问题、1000 个符号的基序、20000 个匹配和 10000000 次符号比较。超出任一限制会拒绝整个报告。每个导出限 3000000 个字符;带类型的 CSV 允许 200000 个值。预览显示 200 行。处理在 10 秒后停止。 最多 500,000 个字符。 运行前请检查设置。

处理结果

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FASTA 验证器
  1. 粘贴 FASTA 记录,选择 DNA、RNA 或蛋白质。
  2. 仅当输入使用比对缺口时,才启用字面缺口。
  3. 检查每个问题并下载完整诊断报告。

使用须知

检查严格的 FASTA 格式:每条记录须有以 > 开头的一行标头、唯一的首个词元标识符和非空序列。DNA 与 RNA 使用各自的 IUPAC 字母表。蛋白质允许标准氨基酸以及 B、X、Z、J、U、O 和 *。允许小写。忽略空行;序列中的空白、数字、注释、混用的 T/U 和不支持的符号会连同行列位置一起报告。可选缺口使用字面字符 -。这是格式验证,不是 GenBank 提交要求检查或生物学质量评估。 在本地运行,无需上传或查询数据库。限制:输入共 500000 个字符、2000 条记录、2000 个验证问题、1000 个符号的基序、20000 个匹配和 10000000 次符号比较。超出任一限制会拒绝整个报告。每个导出限 3000000 个字符;带类型的 CSV 允许 200000 个值。预览显示 200 行。处理在 10 秒后停止。

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