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Validador FASTA

Encontre registos FASTA malformados e símbolos DNA, RNA ou proteicos inválidos com indicação da linha e coluna.

Verifica um perfil FASTA rigoroso com uma linha de cabeçalho iniciada por >, identificador único no primeiro elemento e sequência não vazia por registo. DNA e RNA usam alfabetos IUPAC distintos. Proteínas aceitam aminoácidos padrão mais B, X, Z, J, U, O e *. Aceita minúsculas. Ignora linhas vazias; espaços, algarismos, comentários, T/U misturados e símbolos inválidos são indicados com linha e coluna. Lacunas opcionais são - literais. Valida o formato, não os requisitos de envio GenBank nem a qualidade biológica. Executado localmente sem carregamentos nem pesquisas em bases de dados. Limites: 500000 carateres combinados, 2000 registos, 2000 problemas, motivo com 1000 símbolos, 20000 correspondências e 10000000 comparações. Exceder um limite rejeita o relatório completo. Cada exportação permite 3000000 carateres; CSV tipado 200000 valores. Pré-visualização de 200 linhas. Para após 10 segundos. Até 500 000 caracteres. Reveja as definições antes de executar.

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Validador FASTA
  1. Cole registos FASTA e escolha DNA, RNA ou proteína.
  2. Permita lacunas literais de alinhamento apenas se existirem na entrada.
  3. Reveja cada problema e descarregue o diagnóstico completo.

O que esperar

Verifica um perfil FASTA rigoroso com uma linha de cabeçalho iniciada por >, identificador único no primeiro elemento e sequência não vazia por registo. DNA e RNA usam alfabetos IUPAC distintos. Proteínas aceitam aminoácidos padrão mais B, X, Z, J, U, O e *. Aceita minúsculas. Ignora linhas vazias; espaços, algarismos, comentários, T/U misturados e símbolos inválidos são indicados com linha e coluna. Lacunas opcionais são - literais. Valida o formato, não os requisitos de envio GenBank nem a qualidade biológica. Executado localmente sem carregamentos nem pesquisas em bases de dados. Limites: 500000 carateres combinados, 2000 registos, 2000 problemas, motivo com 1000 símbolos, 20000 correspondências e 10000000 comparações. Exceder um limite rejeita o relatório completo. Cada exportação permite 3000000 carateres; CSV tipado 200000 valores. Pré-visualização de 200 linhas. Para após 10 segundos.

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