Валидатор FASTA
Находите неверно оформленные записи FASTA и недопустимые символы DNA, RNA или белка с указанием строки и столбца.
Проверяет строгий профиль FASTA: одна строка заголовка, начинающаяся с >, уникальный идентификатор в первом слове и непустая последовательность для каждой записи. DNA и RNA используют отдельные алфавиты IUPAC. Для белков допустимы стандартные аминокислоты, а также B, X, Z, J, U, O и *. Строчные буквы разрешены. Пустые строки игнорируются; пробелы в последовательности, цифры, комментарии, смешение T/U и неподдерживаемые символы отмечаются с указанием строки и столбца. Необязательные пропуски обозначаются знаком -. Это проверка формата, а не требований подачи в GenBank или биологического качества. Работает локально без загрузки данных или обращения к базам. Ограничения: 500000 символов ввода суммарно, 2000 записей, 2000 ошибок проверки, мотив длиной 1000 символов, 20000 совпадений и 10000000 сравнений символов. Превышение ограничения отклоняет весь отчёт. Каждый экспорт ограничен 3000000 символов; типизированный CSV допускает 200000 значений. Предпросмотр показывает 200 строк. Обработка останавливается через 10 секунд. До 500 000 символов. Проверьте настройки перед запуском.
Ваш результат
Валидатор FASTA
- Вставьте записи FASTA и выберите DNA, RNA или белок.
- Разрешайте буквальные пропуски выравнивания только при их наличии во входных данных.
- Проверьте каждую ошибку и скачайте полный диагностический отчёт.
Что нужно знать
Проверяет строгий профиль FASTA: одна строка заголовка, начинающаяся с >, уникальный идентификатор в первом слове и непустая последовательность для каждой записи. DNA и RNA используют отдельные алфавиты IUPAC. Для белков допустимы стандартные аминокислоты, а также B, X, Z, J, U, O и *. Строчные буквы разрешены. Пустые строки игнорируются; пробелы в последовательности, цифры, комментарии, смешение T/U и неподдерживаемые символы отмечаются с указанием строки и столбца. Необязательные пропуски обозначаются знаком -. Это проверка формата, а не требований подачи в GenBank или биологического качества. Работает локально без загрузки данных или обращения к базам. Ограничения: 500000 символов ввода суммарно, 2000 записей, 2000 ошибок проверки, мотив длиной 1000 символов, 20000 совпадений и 10000000 сравнений символов. Превышение ограничения отклоняет весь отчёт. Каждый экспорт ограничен 3000000 символов; типизированный CSV допускает 200000 значений. Предпросмотр показывает 200 строк. Обработка останавливается через 10 секунд.