happytails.ai
Български

Валидатор FASTA

Намерете неправилно оформени записи FASTA и недопустими символи DNA, RNA или белтъци с диагностика по ред и колона.

Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.

Вашият резултат

Съобщете за проблем или споделете идея.

Валидатор FASTA
  1. Поставете записи FASTA и изберете DNA, RNA или белтък.
  2. Разрешете буквални празнини при подравняване само ако входът ги използва.
  3. Прегледайте всеки проблем и изтеглете пълния диагностичен отчет.

Какво да очаквате

Проверява строг профил FASTA: един ред на заглавието, започващ с >, уникален идентификатор като първа дума и непразна последователност за всеки запис. DNA и RNA използват отделни азбуки IUPAC. За белтъци се приемат стандартните аминокиселини, както и B, X, Z, J, U, O и *. Малки букви са разрешени. Празните редове се игнорират; интервали в последователността, цифри, коментари, смесване на T/U и неподдържани символи се посочват с ред и колона. Незадължителните празнини се обозначават със знак -. Това е проверка на формата, а не на изискванията за подаване в GenBank или на биологичното качество. Работи локално без качване или заявки към бази данни. Ограничения: общо 500000 входни символа, 2000 записа, 2000 проблема при проверка, мотив от 1000 символа, 20000 съвпадения и 10000000 сравнения на символи. Превишаването на ограничение отхвърля целия отчет. Всеки експорт е ограничен до 3000000 символа; типизираният CSV допуска 200000 стойности. Прегледът показва 200 реда. Обработката спира след 10 секунди.