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Validatore FASTA

Trova record FASTA malformati e simboli DNA, RNA o proteici non validi con riga e colonna.

Verifica un profilo FASTA rigoroso con un’intestazione che inizia con >, identificatore univoco nel primo token e sequenza non vuota per record. DNA e RNA usano alfabeti IUPAC distinti. Le proteine accettano gli amminoacidi standard più B, X, Z, J, U, O e *. Sono ammesse minuscole. Le righe vuote sono ignorate; spazi, cifre, commenti, T/U misti e simboli non supportati sono segnalati con riga e colonna. I gap facoltativi sono - letterali. Verifica il formato, non l’invio a GenBank o la qualità biologica. Esecuzione locale senza caricamenti o ricerche in banca dati. Limiti: 500000 caratteri complessivi, 2000 record, 2000 problemi, motivo di 1000 simboli, 20000 corrispondenze e 10000000 confronti. Superare un limite rifiuta l’intero rapporto. Ogni esportazione ha massimo 3000000 caratteri; CSV tipizzato 200000 valori. Anteprima di 200 righe. Elaborazione interrotta dopo 10 secondi. Fino a 500.000 caratteri. Controlla le impostazioni prima di eseguire.

Il tuo risultato

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Validatore FASTA
  1. Incolla record FASTA e scegli DNA, RNA o proteina.
  2. Consenti gap letterali di allineamento solo se presenti nell’input.
  3. Esamina ogni problema e scarica il rapporto diagnostico completo.

Cosa aspettarsi

Verifica un profilo FASTA rigoroso con un’intestazione che inizia con >, identificatore univoco nel primo token e sequenza non vuota per record. DNA e RNA usano alfabeti IUPAC distinti. Le proteine accettano gli amminoacidi standard più B, X, Z, J, U, O e *. Sono ammesse minuscole. Le righe vuote sono ignorate; spazi, cifre, commenti, T/U misti e simboli non supportati sono segnalati con riga e colonna. I gap facoltativi sono - letterali. Verifica il formato, non l’invio a GenBank o la qualità biologica. Esecuzione locale senza caricamenti o ricerche in banca dati. Limiti: 500000 caratteri complessivi, 2000 record, 2000 problemi, motivo di 1000 simboli, 20000 corrispondenze e 10000000 confronti. Superare un limite rifiuta l’intero rapporto. Ogni esportazione ha massimo 3000000 caratteri; CSV tipizzato 200000 valori. Anteprima di 200 righe. Elaborazione interrotta dopo 10 secondi.

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