FASTA tikrintuvas
Raskite netaisyklingus FASTA įrašus ir netinkamus DNA, RNA ar baltymų simbolius su eilučių ir stulpelių diagnostika.
Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.
Jūsų rezultatas
FASTA tikrintuvas
- Įklijuokite FASTA įrašus ir pasirinkite DNA, RNA arba baltymą.
- Pažodinius lygiavimo tarpus įjunkite tik jei jie naudojami įvestyje.
- Peržiūrėkite kiekvieną problemą ir atsisiųskite visą diagnostikos ataskaitą.
Ką verta žinoti
Tikrina griežtą FASTA formatą: kiekviename įraše turi būti antraštės eilutė, prasidedanti >, unikalus pirmojo žetono identifikatorius ir netuščia seka. DNA ir RNA naudoja atskiras IUPAC abėcėles. Baltymams leidžiamos standartinės aminorūgštys bei B, X, Z, J, U, O ir *. Mažosios raidės leidžiamos. Tuščios eilutės praleidžiamos; sekos tarpai, skaitmenys, komentarai, mišrūs T/U ir nepalaikomi simboliai nurodomi su eilute ir stulpeliu. Pasirenkami tarpai žymimi pažodiniu - simboliu. Tai formato, o ne GenBank pateikimo reikalavimų ar biologinės kokybės patikra. Veikia vietoje be įkėlimo ar duomenų bazės paieškos. Ribos: iš viso 500000 įvesties simbolių, 2000 įrašų, 2000 patikros problemų, 1000 simbolių motyvas, 20000 atitikmenų ir 10000000 simbolių palyginimų. Viršijus ribą atmetama visa ataskaita. Kiekvienas eksportas ribojamas iki 3000000 simbolių; tipizuotame CSV leidžiama 200000 reikšmių. Peržiūroje rodoma 200 eilučių. Apdorojimas nutraukiamas po 10 sekundžių.