happytails.ai
Dansk

FASTA-validering

Find ugyldige FASTA-poster og DNA-, RNA- eller proteinsymboler med linje- og kolonnediagnostik.

Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.

Dit resultat

Rapportér et problem, eller del en idé.

FASTA-validering
  1. Indsæt FASTA-poster og vælg DNA, RNA eller protein.
  2. Tillad kun bogstavelige justeringshuller, hvis input bruger dem.
  3. Gennemgå hvert problem og download hele diagnoserapporten.

Det skal du vide

Kontrollerer en streng FASTA-profil med én overskriftslinje, der starter med >, en entydig identifikator som første token og en ikke-tom sekvens pr. post. DNA og RNA bruger særskilte IUPAC-alfabeter. Protein tillader standardaminosyrer samt B, X, Z, J, U, O og *. Små bogstaver accepteres. Tomme linjer ignoreres; mellemrum, cifre, kommentarer, blandet T/U og ugyldige symboler i sekvenser rapporteres med linje og kolonne. Valgfrie huller er bogstavelige -. Dette kontrollerer format, ikke GenBank-indsendelse eller biologisk kvalitet. Kører lokalt uden uploads eller databaseopslag. Grænser: 500000 samlede inputtegn, 2000 poster, 2000 valideringsproblemer, motiv på 1000 symboler, 20000 fund og 10000000 symbolsammenligninger. Overskridelse afviser hele rapporten. Hver eksport må have 3000000 tegn; typet CSV tillader 200000 værdier. Forhåndsvisning viser 200 rækker. Behandlingen stopper efter 10 sekunder.