FASTA-Prüfer
Fehlerhafte FASTA-Einträge und unzulässige DNA-, RNA- oder Proteinsymbole mit Zeilen- und Spaltenangaben finden.
Prüft ein strenges FASTA-Profil mit einer Kopfzeile ab >, eindeutiger Kennung als erstem Token und nicht leerer Sequenz je Eintrag. DNA und RNA verwenden getrennte IUPAC-Alphabete. Protein erlaubt Standardaminosäuren sowie B, X, Z, J, U, O und *. Kleinbuchstaben sind zulässig. Leerzeilen werden ignoriert; Leerraum, Ziffern, Kommentare, gemischtes T/U und unzulässige Sequenzzeichen werden mit Zeile und Spalte gemeldet. Optionale Lücken sind wörtliche -. Dies prüft das Format, keine GenBank-Einreichung oder biologische Qualität. Läuft lokal ohne Upload oder Datenbankabfrage. Grenzen: insgesamt 500000 Eingabezeichen, 2000 Einträge, 2000 Validierungsprobleme, Motiv mit 1000 Symbolen, 20000 Treffer und 10000000 Symbolvergleiche. Grenzverletzung verwirft den gesamten Bericht. Jeder Export höchstens 3000000 Zeichen; typisierte CSV höchstens 200000 Werte. Vorschau mit 200 Zeilen. Verarbeitung endet nach 10 Sekunden. Bis zu 500.000 Zeichen. Prüfe die Einstellungen vor dem Start.
Dein Ergebnis
FASTA-Prüfer
- FASTA-Einträge einfügen und DNA, RNA oder Protein wählen.
- Wörtliche Alignmentlücken nur aktivieren, wenn die Eingabe sie verwendet.
- Jedes Problem prüfen und vollständigen Diagnosebericht herunterladen.
Was du wissen solltest
Prüft ein strenges FASTA-Profil mit einer Kopfzeile ab >, eindeutiger Kennung als erstem Token und nicht leerer Sequenz je Eintrag. DNA und RNA verwenden getrennte IUPAC-Alphabete. Protein erlaubt Standardaminosäuren sowie B, X, Z, J, U, O und *. Kleinbuchstaben sind zulässig. Leerzeilen werden ignoriert; Leerraum, Ziffern, Kommentare, gemischtes T/U und unzulässige Sequenzzeichen werden mit Zeile und Spalte gemeldet. Optionale Lücken sind wörtliche -. Dies prüft das Format, keine GenBank-Einreichung oder biologische Qualität. Läuft lokal ohne Upload oder Datenbankabfrage. Grenzen: insgesamt 500000 Eingabezeichen, 2000 Einträge, 2000 Validierungsprobleme, Motiv mit 1000 Symbolen, 20000 Treffer und 10000000 Symbolvergleiche. Grenzverletzung verwirft den gesamten Bericht. Jeder Export höchstens 3000000 Zeichen; typisierte CSV höchstens 200000 Werte. Vorschau mit 200 Zeilen. Verarbeitung endet nach 10 Sekunden.