Обратный комплемент последовательности
Создавайте обратные комплементы последовательностей DNA или RNA в FASTA с любыми символами неоднозначности IUPAC, сохраняя исходный регистр и заголовки.
Создаёт обратно-комплементарную последовательность каждой записи FASTA с полным алфавитом неоднозначности IUPAC для DNA или RNA. Для DNA используется A/T, для RNA: A/U. Регистр и необязательные пропуски - сохраняются; порядок пропусков обращается вместе с последовательностью. Исходные идентификаторы и полные заголовки сохраняются. Аннотации заголовков и координаты биологических признаков не переписываются. Инструмент не переводит последовательности в белки и не определяет биологическую цепь. Работает локально без загрузки данных или обращения к базам. Ограничения: 500000 символов ввода суммарно, 2000 записей, 2000 ошибок проверки, мотив длиной 1000 символов, 20000 совпадений и 10000000 сравнений символов. Превышение ограничения отклоняет весь отчёт. Каждый экспорт ограничен 3000000 символов; типизированный CSV допускает 200000 значений. Предпросмотр показывает 200 строк. Обработка останавливается через 10 секунд. До 500 000 символов. Проверьте настройки перед запуском.
Ваш результат
Обратный комплемент последовательности
- Вставьте FASTA и выберите DNA или RNA.
- Разрешайте буквальные пропуски только для выровненных последовательностей.
- Проверьте длины последовательностей и скачайте обратно-комплементарный FASTA и отчёт.
Что нужно знать
Создаёт обратно-комплементарную последовательность каждой записи FASTA с полным алфавитом неоднозначности IUPAC для DNA или RNA. Для DNA используется A/T, для RNA: A/U. Регистр и необязательные пропуски - сохраняются; порядок пропусков обращается вместе с последовательностью. Исходные идентификаторы и полные заголовки сохраняются. Аннотации заголовков и координаты биологических признаков не переписываются. Инструмент не переводит последовательности в белки и не определяет биологическую цепь. Работает локально без загрузки данных или обращения к базам. Ограничения: 500000 символов ввода суммарно, 2000 записей, 2000 ошибок проверки, мотив длиной 1000 символов, 20000 совпадений и 10000000 сравнений символов. Превышение ограничения отклоняет весь отчёт. Каждый экспорт ограничен 3000000 символов; типизированный CSV допускает 200000 значений. Предпросмотр показывает 200 строк. Обработка останавливается через 10 секунд.