FASTA-validator
Vind onjuiste FASTA-records en ongeldige DNA-, RNA- of eiwitsymbolen met regel- en kolomdiagnostiek.
Controleert een strikt FASTA-profiel met één kopregel beginnend met >, een unieke eerste-tokenidentificatie en een niet-lege sequentie per record. DNA en RNA gebruiken aparte IUPAC-alfabetten. Eiwitten accepteren de standaardaminozuren plus B, X, Z, J, U, O en *. Kleine letters zijn toegestaan. Lege regels worden genegeerd; witruimte, cijfers, opmerkingen, gemengde T/U en ongeldige symbolen worden met regel en kolom gemeld. Optionele gaten zijn letterlijke -. Dit controleert formaat, geen GenBank-inzending of biologische kwaliteit. Werkt lokaal zonder uploads of databasezoekactie. Grenzen: samen 500000 invoertekens, 2000 records, 2000 validatieproblemen, motief van 1000 symbolen, 20000 treffers en 10000000 symboolvergelijkingen. Overschrijding weigert het hele rapport. Elke export maximaal 3000000 tekens; getypeerde CSV maximaal 200000 waarden. Voorbeeld van 200 rijen. Verwerking stopt na 10 seconden. Maximaal 500.000 tekens. Controleer de instellingen voordat je de analyse uitvoert.
Je resultaat
FASTA-validator
- Plak FASTA-records en kies DNA, RNA of eiwit.
- Sta letterlijke uitlijningsgaten alleen toe als de invoer ze gebruikt.
- Bekijk elk probleem en download het volledige diagnoserapport.
Wat je kunt verwachten
Controleert een strikt FASTA-profiel met één kopregel beginnend met >, een unieke eerste-tokenidentificatie en een niet-lege sequentie per record. DNA en RNA gebruiken aparte IUPAC-alfabetten. Eiwitten accepteren de standaardaminozuren plus B, X, Z, J, U, O en *. Kleine letters zijn toegestaan. Lege regels worden genegeerd; witruimte, cijfers, opmerkingen, gemengde T/U en ongeldige symbolen worden met regel en kolom gemeld. Optionele gaten zijn letterlijke -. Dit controleert formaat, geen GenBank-inzending of biologische kwaliteit. Werkt lokaal zonder uploads of databasezoekactie. Grenzen: samen 500000 invoertekens, 2000 records, 2000 validatieproblemen, motief van 1000 symbolen, 20000 treffers en 10000000 symboolvergelijkingen. Overschrijding weigert het hele rapport. Elke export maximaal 3000000 tekens; getypeerde CSV maximaal 200000 waarden. Voorbeeld van 200 rijen. Verwerking stopt na 10 seconden.