Validator FASTA
Poiščite napačno oblikovane zapise FASTA in nedovoljene simbole DNA, RNA ali beljakovin z diagnostiko vrstice in stolpca.
Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.
Vaš rezultat
Validator FASTA
- Prilepite zapise FASTA in izberite DNA, RNA ali beljakovino.
- Dobesedne vrzeli poravnave omogočite samo, če jih vhod uporablja.
- Preglejte vsako težavo in prenesite celotno diagnostično poročilo.
Kaj lahko pričakujete
Preveri strog profil FASTA z eno vrstico glave, ki se začne z >, enoličnim identifikatorjem v prvi besedi in nepraznim zaporedjem za vsak zapis. DNA in RNA uporabljata ločeni abecedi IUPAC. Pri beljakovinah so dovoljene standardne aminokisline ter B, X, Z, J, U, O in *. Male črke so dovoljene. Prazne vrstice se prezrejo; presledki v zaporedju, številke, komentarji, mešanje T/U in nepodprti simboli se navedejo z vrstico in stolpcem. Neobvezne vrzeli so označene z znakom -. To je preverjanje oblike, ne zahtev za oddajo v GenBank ali biološke kakovosti. Deluje lokalno brez nalaganja ali poizvedb v zbirkah podatkov. Omejitve: skupaj 500000 vhodnih znakov, 2000 zapisov, 2000 težav pri preverjanju, motiv s 1000 simboli, 20000 ujemanj in 10000000 primerjav simbolov. Prekoračitev omejitve zavrne celotno poročilo. Vsak izvoz je omejen na 3000000 znakov; tipizirani CSV dovoljuje 200000 vrednosti. Predogled prikaže 200 vrstic. Obdelava se ustavi po 10 sekundah.