happytails.ai
Svenska

FASTA-validerare

Hitta felaktiga FASTA-poster och otillåtna DNA-, RNA- eller proteinsymboler med rad- och kolumndiagnostik.

Kontrollerar en strikt FASTA-profil med en rubrikrad som börjar med >, en unik identifierare som första token och en icke-tom sekvens per post. DNA och RNA använder separata IUPAC-alfabet. Protein tillåter standardaminosyror samt B, X, Z, J, U, O och *. Gemener godtas. Tomma rader ignoreras; blanktecken, siffror, kommentarer, blandat T/U och otillåtna sekvenssymboler rapporteras med rad och kolumn. Valfria luckor är bokstavliga -. Detta validerar format, inte GenBank-inlämning eller biologisk kvalitet. Körs lokalt utan uppladdning eller databasuppslag. Gränser: 500000 sammanlagda indatatecken, 2000 poster, 2000 valideringsproblem, motiv på 1000 symboler, 20000 träffar och 10000000 symboljämförelser. Överskridande avvisar hela rapporten. Varje export begränsas till 3000000 tecken; typad CSV tillåter 200000 värden. Förhandsvisning visar 200 rader. Bearbetning stoppas efter 10 sekunder. Upp till 500 000 tecken. Kontrollera inställningarna innan du kör.

Ditt resultat

Rapportera ett problem eller dela en idé.

FASTA-validerare
  1. Klistra in FASTA-poster och välj DNA, RNA eller protein.
  2. Tillåt bokstavliga justeringsluckor endast om de finns i indata.
  3. Granska varje problem och ladda ned hela diagnosrapporten.

Vad du kan förvänta dig

Kontrollerar en strikt FASTA-profil med en rubrikrad som börjar med >, en unik identifierare som första token och en icke-tom sekvens per post. DNA och RNA använder separata IUPAC-alfabet. Protein tillåter standardaminosyror samt B, X, Z, J, U, O och *. Gemener godtas. Tomma rader ignoreras; blanktecken, siffror, kommentarer, blandat T/U och otillåtna sekvenssymboler rapporteras med rad och kolumn. Valfria luckor är bokstavliga -. Detta validerar format, inte GenBank-inlämning eller biologisk kvalitet. Körs lokalt utan uppladdning eller databasuppslag. Gränser: 500000 sammanlagda indatatecken, 2000 poster, 2000 valideringsproblem, motiv på 1000 symboler, 20000 träffar och 10000000 symboljämförelser. Överskridande avvisar hela rapporten. Varje export begränsas till 3000000 tecken; typad CSV tillåter 200000 värden. Förhandsvisning visar 200 rader. Bearbetning stoppas efter 10 sekunder.

Användbara nästa steg