FASTA doğrulayıcı
Bozuk FASTA kayıtlarını ve geçersiz DNA, RNA veya protein sembollerini satır ve sütun bilgisiyle bulun.
> ile başlayan tek başlık satırı, benzersiz ilk belirteç kimliği ve her kayıt için boş olmayan dizi gerektiren katı FASTA profilini denetler. DNA ve RNA ayrı IUPAC alfabeleri kullanır. Protein, standart aminoasitlere ek B, X, Z, J, U, O ve * kabul eder. Küçük harfler kabul edilir. Boş satırlar atlanır; boşluklar, rakamlar, yorumlar, karışık T/U ve desteklenmeyen semboller satır ve sütunla bildirilir. İsteğe bağlı boşluklar gerçek - karakteridir. Bu, biçim doğrulamasıdır; GenBank gönderim veya biyolojik kalite denetimi değildir. Yükleme veya veri tabanı sorgusu olmadan yerel çalışır. Sınırlar: toplam 500000 girdi karakteri, 2000 kayıt, 2000 doğrulama sorunu, 1000 sembollü motif, 20000 eşleşme ve 10000000 sembol karşılaştırması. Sınır aşılırsa tam rapor reddedilir. Her dışa aktarım en fazla 3000000 karakter; tür bilgili CSV 200000 değer. Önizleme 200 satır gösterir. İşlem 10 saniye sonra durur. En fazla 500.000 karakter. Çalıştırmadan önce ayarları gözden geçirin.
Sonucunuz
FASTA doğrulayıcı
- FASTA kayıtlarını yapıştırıp DNA, RNA veya protein seçin.
- Gerçek hizalama boşluklarını yalnızca girdide kullanılıyorsa etkinleştirin.
- Her sorunu inceleyip tam tanı raporunu indirin.
Bilmeniz gerekenler
> ile başlayan tek başlık satırı, benzersiz ilk belirteç kimliği ve her kayıt için boş olmayan dizi gerektiren katı FASTA profilini denetler. DNA ve RNA ayrı IUPAC alfabeleri kullanır. Protein, standart aminoasitlere ek B, X, Z, J, U, O ve * kabul eder. Küçük harfler kabul edilir. Boş satırlar atlanır; boşluklar, rakamlar, yorumlar, karışık T/U ve desteklenmeyen semboller satır ve sütunla bildirilir. İsteğe bağlı boşluklar gerçek - karakteridir. Bu, biçim doğrulamasıdır; GenBank gönderim veya biyolojik kalite denetimi değildir. Yükleme veya veri tabanı sorgusu olmadan yerel çalışır. Sınırlar: toplam 500000 girdi karakteri, 2000 kayıt, 2000 doğrulama sorunu, 1000 sembollü motif, 20000 eşleşme ve 10000000 sembol karşılaştırması. Sınır aşılırsa tam rapor reddedilir. Her dışa aktarım en fazla 3000000 karakter; tür bilgili CSV 200000 değer. Önizleme 200 satır gösterir. İşlem 10 saniye sonra durur.