Валідатор FASTA
Знаходьте неправильно оформлені записи FASTA та недопустимі символи DNA, RNA або білка із зазначенням рядка й стовпця.
Перевіряє строгий профіль FASTA: один рядок заголовка, що починається з >, унікальний ідентифікатор у першому слові та непорожня послідовність для кожного запису. DNA і RNA використовують окремі алфавіти IUPAC. Для білків дозволено стандартні амінокислоти, а також B, X, Z, J, U, O та *. Малі літери дозволено. Порожні рядки ігноруються; пробіли в послідовності, цифри, коментарі, змішування T/U та непідтримувані символи позначаються із зазначенням рядка й стовпця. Необов'язкові прогалини позначаються знаком -. Це перевірка формату, а не вимог подання до GenBank або біологічної якості. Працює локально без завантаження даних або звернення до баз. Обмеження: 500000 символів введення сумарно, 2000 записів, 2000 помилок перевірки, мотив завдовжки 1000 символів, 20000 збігів і 10000000 порівнянь символів. Перевищення обмеження відхиляє весь звіт. Кожен експорт обмежено 3000000 символів; типізований CSV допускає 200000 значень. Попередній перегляд показує 200 рядків. Обробка зупиняється через 10 секунд. До 500 000 символів. Перевірте налаштування перед запуском.
Ваш результат
Валідатор FASTA
- Вставте записи FASTA та виберіть DNA, RNA або білок.
- Дозволяйте буквальні прогалини вирівнювання лише за їх наявності у вхідних даних.
- Перевірте кожну помилку та завантажте повний діагностичний звіт.
Що варто знати
Перевіряє строгий профіль FASTA: один рядок заголовка, що починається з >, унікальний ідентифікатор у першому слові та непорожня послідовність для кожного запису. DNA і RNA використовують окремі алфавіти IUPAC. Для білків дозволено стандартні амінокислоти, а також B, X, Z, J, U, O та *. Малі літери дозволено. Порожні рядки ігноруються; пробіли в послідовності, цифри, коментарі, змішування T/U та непідтримувані символи позначаються із зазначенням рядка й стовпця. Необов'язкові прогалини позначаються знаком -. Це перевірка формату, а не вимог подання до GenBank або біологічної якості. Працює локально без завантаження даних або звернення до баз. Обмеження: 500000 символів введення сумарно, 2000 записів, 2000 помилок перевірки, мотив завдовжки 1000 символів, 20000 збігів і 10000000 порівнянь символів. Перевищення обмеження відхиляє весь звіт. Кожен експорт обмежено 3000000 символів; типізований CSV допускає 200000 значень. Попередній перегляд показує 200 рядків. Обробка зупиняється через 10 секунд.