Validateur FASTA
Repérez les enregistrements FASTA mal formés et les symboles DNA, RNA ou protéiques invalides avec ligne et colonne.
Vérifie un profil FASTA strict : une ligne d’en-tête commençant par >, un identifiant unique comme premier élément et une séquence non vide par enregistrement. DNA et RNA utilisent des alphabets IUPAC distincts. Les protéines acceptent les acides aminés usuels ainsi que B, X, Z, J, U, O et *. Les minuscules sont acceptées. Les lignes vides sont ignorées ; espaces, chiffres, commentaires, mélange T/U et symboles interdits sont signalés avec ligne et colonne. Les lacunes facultatives sont des - littéraux. Validation du format, pas conformité GenBank ni qualité biologique. Calcul local sans téléversement ni recherche en base. Limites : 500000 caractères cumulés, 2000 enregistrements, 2000 problèmes, motif de 1000 symboles, 20000 correspondances et 10000000 comparaisons. Tout dépassement rejette le rapport entier. Chaque export est limité à 3000000 caractères ; le CSV typé à 200000 valeurs. Aperçu de 200 lignes. Arrêt après 10 secondes. Jusqu’à 500 000 caractères. Vérifiez les réglages avant de lancer l’analyse.
Votre résultat
Validateur FASTA
- Collez les enregistrements FASTA et choisissez DNA, RNA ou protéine.
- N’autorisez les lacunes littérales d’alignement que si l’entrée en utilise.
- Examinez chaque problème et téléchargez le diagnostic complet.
À savoir
Vérifie un profil FASTA strict : une ligne d’en-tête commençant par >, un identifiant unique comme premier élément et une séquence non vide par enregistrement. DNA et RNA utilisent des alphabets IUPAC distincts. Les protéines acceptent les acides aminés usuels ainsi que B, X, Z, J, U, O et *. Les minuscules sont acceptées. Les lignes vides sont ignorées ; espaces, chiffres, commentaires, mélange T/U et symboles interdits sont signalés avec ligne et colonne. Les lacunes facultatives sont des - littéraux. Validation du format, pas conformité GenBank ni qualité biologique. Calcul local sans téléversement ni recherche en base. Limites : 500000 caractères cumulés, 2000 enregistrements, 2000 problèmes, motif de 1000 symboles, 20000 correspondances et 10000000 comparaisons. Tout dépassement rejette le rapport entier. Chaque export est limité à 3000000 caractères ; le CSV typé à 200000 valeurs. Aperçu de 200 lignes. Arrêt après 10 secondes.