FASTA-validator
Finn ugyldige FASTA-poster og DNA-, RNA- eller proteinsymboler med linje- og kolonnediagnostikk.
Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.
Resultatet ditt
FASTA-validator
- Lim inn FASTA-poster og velg DNA, RNA eller protein.
- Tillat bokstavelige justeringsgap bare hvis inndata bruker dem.
- Se hvert problem og last ned hele diagnoserapporten.
Dette bør du vite
Kontrollerer en streng FASTA-profil med én overskriftslinje som starter med >, en entydig identifikator som første token og en ikke-tom sekvens per post. DNA og RNA bruker separate IUPAC-alfabeter. Protein godtar standardaminosyrer samt B, X, Z, J, U, O og *. Små bokstaver godtas. Tomme linjer ignoreres; mellomrom, sifre, kommentarer, blandet T/U og ugyldige sekvenssymboler rapporteres med linje og kolonne. Valgfrie gap er bokstavelige -. Dette validerer format, ikke GenBank-innsending eller biologisk kvalitet. Kjører lokalt uten opplasting eller databaseoppslag. Grenser: 500000 samlede inndatategn, 2000 poster, 2000 valideringsproblemer, motiv på 1000 symboler, 20000 treff og 10000000 symbolsammenligninger. Overskridelse avviser hele rapporten. Hver eksport begrenses til 3000000 tegn; typet CSV tillater 200000 verdier. Forhåndsvisningen viser 200 rader. Behandlingen stopper etter 10 sekunder.