Validátor FASTA
Najděte chybně vytvořené záznamy FASTA a nepovolené symboly DNA, RNA nebo proteinů s diagnostikou řádků a sloupců.
Kontroluje přísný profil FASTA s jedním řádkem hlavičky začínajícím >, jedinečným identifikátorem v prvním slově a neprázdnou sekvencí pro každý záznam. DNA a RNA používají oddělené abecedy IUPAC. U proteinů přijímá standardní aminokyseliny i B, X, Z, J, U, O a *. Malá písmena jsou povolena. Prázdné řádky se ignorují; mezery v sekvenci, číslice, komentáře, směs T/U a nepodporované symboly se hlásí s řádkem a sloupcem. Volitelné mezery zarovnání se zapisují jako -. Jde o kontrolu formátu, nikoli požadavků na odevzdání do GenBank nebo biologické kvality. Běží místně bez odesílání nebo dotazů do databází. Limity: celkem 500000 vstupních znaků, 2000 záznamů, 2000 problémů při kontrole, motiv o 1000 symbolech, 20000 shod a 10000000 porovnání symbolů. Překročení limitu odmítne celou zprávu. Každý export je omezen na 3000000 znaků; typovaný CSV dovoluje 200000 hodnot. Náhled zobrazuje 200 řádků. Zpracování se zastaví po 10 sekundách. Nejvýše 500 000 znaků. Před spuštěním zkontrolujte nastavení.
Váš výsledek
Validátor FASTA
- Vložte záznamy FASTA a vyberte DNA, RNA nebo protein.
- Doslovné mezery zarovnání povolte pouze tehdy, když je vstup používá.
- Prohlédněte každý problém a stáhněte úplnou diagnostickou zprávu.
Co očekávat
Kontroluje přísný profil FASTA s jedním řádkem hlavičky začínajícím >, jedinečným identifikátorem v prvním slově a neprázdnou sekvencí pro každý záznam. DNA a RNA používají oddělené abecedy IUPAC. U proteinů přijímá standardní aminokyseliny i B, X, Z, J, U, O a *. Malá písmena jsou povolena. Prázdné řádky se ignorují; mezery v sekvenci, číslice, komentáře, směs T/U a nepodporované symboly se hlásí s řádkem a sloupcem. Volitelné mezery zarovnání se zapisují jako -. Jde o kontrolu formátu, nikoli požadavků na odevzdání do GenBank nebo biologické kvality. Běží místně bez odesílání nebo dotazů do databází. Limity: celkem 500000 vstupních znaků, 2000 záznamů, 2000 problémů při kontrole, motiv o 1000 symbolech, 20000 shod a 10000000 porovnání symbolů. Překročení limitu odmítne celou zprávu. Každý export je omezen na 3000000 znaků; typovaný CSV dovoluje 200000 hodnot. Náhled zobrazuje 200 řádků. Zpracování se zastaví po 10 sekundách.