Validator FASTA
Găsește înregistrări FASTA incorecte și simboluri DNA, RNA sau proteice nepermise, cu diagnostic pe linie și coloană.
Verifică un profil FASTA strict, cu o singură linie de antet care începe cu >, un identificator unic în primul cuvânt și o secvență nevidă pentru fiecare înregistrare. DNA și RNA folosesc alfabete IUPAC separate. Pentru proteine sunt acceptați aminoacizii standard, precum și B, X, Z, J, U, O și *. Sunt acceptate literele mici. Liniile goale sunt ignorate; spațiile din secvență, cifrele, comentariile, amestecul T/U și simbolurile neacceptate sunt raportate cu linia și coloana. Golurile opționale sunt reprezentate prin -. Aceasta este o verificare a formatului, nu a cerințelor de depunere în GenBank sau a calității biologice. Rulează local, fără încărcări sau interogări în baze de date. Limite: 500000 de caractere de intrare în total, 2000 de înregistrări, 2000 de probleme de validare, un motiv de 1000 de simboluri, 20000 de potriviri și 10000000 de comparații de simboluri. Depășirea unei limite respinge întregul raport. Fiecare export este limitat la 3000000 de caractere; CSV tipizat permite 200000 de valori. Previzualizarea afișează 200 de rânduri. Procesarea se oprește după 10 secunde. Până la 500.000 de caractere. Verifică setările înainte de rulare.
Rezultatul tău
Validator FASTA
- Lipește înregistrări FASTA și alege DNA, RNA sau proteină.
- Activează golurile literale de aliniere numai dacă intrarea le folosește.
- Examinează fiecare problemă și descarcă raportul complet de diagnostic.
La ce să te aștepți
Verifică un profil FASTA strict, cu o singură linie de antet care începe cu >, un identificator unic în primul cuvânt și o secvență nevidă pentru fiecare înregistrare. DNA și RNA folosesc alfabete IUPAC separate. Pentru proteine sunt acceptați aminoacizii standard, precum și B, X, Z, J, U, O și *. Sunt acceptate literele mici. Liniile goale sunt ignorate; spațiile din secvență, cifrele, comentariile, amestecul T/U și simbolurile neacceptate sunt raportate cu linia și coloana. Golurile opționale sunt reprezentate prin -. Aceasta este o verificare a formatului, nu a cerințelor de depunere în GenBank sau a calității biologice. Rulează local, fără încărcări sau interogări în baze de date. Limite: 500000 de caractere de intrare în total, 2000 de înregistrări, 2000 de probleme de validare, un motiv de 1000 de simboluri, 20000 de potriviri și 10000000 de comparații de simboluri. Depășirea unei limite respinge întregul raport. Fiecare export este limitat la 3000000 de caractere; CSV tipizat permite 200000 de valori. Previzualizarea afișează 200 de rânduri. Procesarea se oprește după 10 secunde.