happytails.ai
Slovenčina

Validátor FASTA

Nájdite chybne vytvorené záznamy FASTA a nepovolené symboly DNA, RNA alebo proteínov s diagnostikou riadkov a stĺpcov.

Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.

Váš výsledok

Nahláste problém alebo sa podeľte o nápad.

Validátor FASTA
  1. Vložte záznamy FASTA a vyberte DNA, RNA alebo proteín.
  2. Doslovné medzery zarovnania povoľte iba vtedy, keď ich vstup používa.
  3. Prezrite každý problém a stiahnite úplnú diagnostickú správu.

Čo môžete očakávať

Kontroluje prísny profil FASTA s jedným riadkom hlavičky začínajúcim na >, jedinečným identifikátorom v prvom slove a neprázdnou sekvenciou pre každý záznam. DNA a RNA používajú oddelené abecedy IUPAC. Pri proteínoch prijíma štandardné aminokyseliny aj B, X, Z, J, U, O a *. Malé písmená sú povolené. Prázdne riadky sa ignorujú; medzery v sekvencii, číslice, komentáre, zmiešané T/U a nepodporované symboly sa hlásia s riadkom a stĺpcom. Voliteľné medzery zarovnania sa zapisujú ako -. Ide o kontrolu formátu, nie požiadaviek na odovzdanie do GenBank ani biologickej kvality. Beží lokálne bez odosielania alebo dopytov do databáz. Limity: spolu 500000 vstupných znakov, 2000 záznamov, 2000 problémov pri kontrole, motív s 1000 symbolmi, 20000 zhôd a 10000000 porovnaní symbolov. Prekročenie limitu odmietne celú správu. Každý export je obmedzený na 3000000 znakov; typovaný CSV povoľuje 200000 hodnôt. Náhľad zobrazuje 200 riadkov. Spracovanie sa zastaví po 10 sekundách.