happytails.ai
Русский

Извлечение последовательностей FASTA

Выбирайте точные идентификаторы FASTA и необязательные диапазоны с обеими границами включительно, сохраняя заголовки и регистр последовательностей.

Выбирает полные записи FASTA по точному идентификатору либо извлекает один и тот же диапазон координат из каждой выбранной записи. Координаты начинаются с единицы и включают обе границы. Диапазоны не могут переходить через конец записи или выходить за её границы. Пропуски выравнивания считаются позициями. Результат сохраняет исходный идентификатор, полный заголовок и регистр последовательности; координаты записываются отдельно в JSON и CSV. Существующие аннотации в заголовках после извлечения не пересчитываются. Работает локально без загрузки данных или обращения к базам. Ограничения: 500000 символов ввода суммарно, 2000 записей, 2000 ошибок проверки, мотив длиной 1000 символов, 20000 совпадений и 10000000 сравнений символов. Превышение ограничения отклоняет весь отчёт. Каждый экспорт ограничен 3000000 символов; типизированный CSV допускает 200000 значений. Предпросмотр показывает 200 строк. Обработка останавливается через 10 секунд. До 500 000 символов. Проверьте настройки перед запуском.

Ваш результат

Сообщите о проблеме или поделитесь идеей.

Извлечение последовательностей FASTA
  1. Вставьте корректный FASTA и выберите его алфавит.
  2. Перечислите точные идентификаторы в нужном порядке и при необходимости укажите обе координаты.
  3. Проверьте выбранные длины и скачайте последовательности FASTA и полный отчёт.

Что нужно знать

Выбирает полные записи FASTA по точному идентификатору либо извлекает один и тот же диапазон координат из каждой выбранной записи. Координаты начинаются с единицы и включают обе границы. Диапазоны не могут переходить через конец записи или выходить за её границы. Пропуски выравнивания считаются позициями. Результат сохраняет исходный идентификатор, полный заголовок и регистр последовательности; координаты записываются отдельно в JSON и CSV. Существующие аннотации в заголовках после извлечения не пересчитываются. Работает локально без загрузки данных или обращения к базам. Ограничения: 500000 символов ввода суммарно, 2000 записей, 2000 ошибок проверки, мотив длиной 1000 символов, 20000 совпадений и 10000000 сравнений символов. Превышение ограничения отклоняет весь отчёт. Каждый экспорт ограничен 3000000 символов; типизированный CSV допускает 200000 значений. Предпросмотр показывает 200 строк. Обработка останавливается через 10 секунд.

Что можно сделать дальше