Walidator FASTA
Znajdź błędnie sformowane rekordy FASTA i niedozwolone symbole DNA, RNA lub białek z diagnostyką wierszy i kolumn.
Sprawdza ścisły profil FASTA: jeden wiersz nagłówka zaczynający się od >, unikalny identyfikator jako pierwsze słowo i niepusta sekwencja dla każdego rekordu. DNA i RNA używają osobnych alfabetów IUPAC. Dla białek dozwolone są standardowe aminokwasy oraz B, X, Z, J, U, O i *. Małe litery są dozwolone. Puste wiersze są pomijane; odstępy w sekwencji, cyfry, komentarze, mieszane T/U i nieobsługiwane symbole są zgłaszane z numerem wiersza i kolumny. Opcjonalne luki oznacza znak -. Jest to sprawdzenie formatu, a nie wymagań zgłoszenia do GenBank ani jakości biologicznej. Działa lokalnie bez przesyłania danych ani zapytań do baz. Limity: łącznie 500000 znaków wejściowych, 2000 rekordów, 2000 problemów walidacji, motyw z 1000 symboli, 20000 dopasowań i 10000000 porównań symboli. Przekroczenie limitu odrzuca cały raport. Każdy eksport jest ograniczony do 3000000 znaków; typowany CSV dopuszcza 200000 wartości. Podgląd pokazuje 200 wierszy. Przetwarzanie zatrzymuje się po 10 sekundach. Do 500000 znaków. Sprawdź ustawienia przed uruchomieniem.
Twój wynik
Walidator FASTA
- Wklej rekordy FASTA i wybierz DNA, RNA lub białko.
- Zezwól na dosłowne luki przyrównania tylko wtedy, gdy występują w danych.
- Przejrzyj każdy problem i pobierz pełny raport diagnostyczny.
Warto wiedzieć
Sprawdza ścisły profil FASTA: jeden wiersz nagłówka zaczynający się od >, unikalny identyfikator jako pierwsze słowo i niepusta sekwencja dla każdego rekordu. DNA i RNA używają osobnych alfabetów IUPAC. Dla białek dozwolone są standardowe aminokwasy oraz B, X, Z, J, U, O i *. Małe litery są dozwolone. Puste wiersze są pomijane; odstępy w sekwencji, cyfry, komentarze, mieszane T/U i nieobsługiwane symbole są zgłaszane z numerem wiersza i kolumny. Opcjonalne luki oznacza znak -. Jest to sprawdzenie formatu, a nie wymagań zgłoszenia do GenBank ani jakości biologicznej. Działa lokalnie bez przesyłania danych ani zapytań do baz. Limity: łącznie 500000 znaków wejściowych, 2000 rekordów, 2000 problemów walidacji, motyw z 1000 symboli, 20000 dopasowań i 10000000 porównań symboli. Przekroczenie limitu odrzuca cały raport. Każdy eksport jest ograniczony do 3000000 znaków; typowany CSV dopuszcza 200000 wartości. Podgląd pokazuje 200 wierszy. Przetwarzanie zatrzymuje się po 10 sekundach.