FASTA-kontrollija
Leidke vigased FASTA-kirjed ja lubamatud DNA, RNA või valgu sümbolid rea- ja veerudiagnostikaga.
Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.
Sinu tulemus
FASTA-kontrollija
- Kleepige FASTA-kirjed ja valige DNA, RNA või valk.
- Lubage otsesed joonduslüngad ainult siis, kui sisend neid kasutab.
- Vaadake üle iga viga ja laadige alla täielik diagnostikaaruanne.
Mida tasub teada
Kontrollib ranget FASTA-vormingut: igal kirjel on > märgiga algav päiserida, kordumatu esimesest sõnest koosnev tunnus ja mittetühi järjestus. DNA ja RNA kasutavad eraldi IUPAC-tähestikke. Valkude puhul lubatakse standardseid aminohappeid ning B, X, Z, J, U, O ja *. Väiketähed on lubatud. Tühje ridu eiratakse; järjestuse tühikud, numbrid, kommentaarid, segatud T/U ja toetamata sümbolid teatatakse koos rea ja veeruga. Valikulised lüngad on otsesed - märgid. See on vormingukontroll, mitte GenBanki esitamisnõuete või bioloogilise kvaliteedi hindamine. Töötab kohapeal üleslaadimiste ja andmebaasipäringuteta. Piirangud: kokku 500000 sisendmärki, 2000 kirjet, 2000 kontrolliviga, 1000 sümboli pikkune motiiv, 20000 vastet ja 10000000 sümbolivõrdlust. Piiri ületamisel lükatakse kogu aruanne tagasi. Iga eksport on kuni 3000000 märki; tüübistatud CSV lubab 200000 väärtust. Eelvaates on 200 rida. Töötlus peatub 10 sekundi pärast.