FASTA pārbaudītājs
Atrodiet nepareizus FASTA ierakstus un nederīgus DNA, RNA vai proteīnu simbolus ar rindu un kolonnu diagnostiku.
Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.
Jūsu rezultāts
FASTA pārbaudītājs
- Ielīmējiet FASTA ierakstus un izvēlieties DNA, RNA vai proteīnu.
- Burtiskas līdzinājuma spraugas atļaujiet tikai tad, ja tās ir ievadē.
- Pārskatiet katru problēmu un lejupielādējiet pilnu diagnostikas pārskatu.
Kas jāzina
Pārbauda stingru FASTA formātu: katram ierakstam ir viena galvenes rinda, kas sākas ar >, unikāls pirmā marķiera identifikators un netukša secība. DNA un RNA izmanto atsevišķus IUPAC alfabētus. Proteīniem pieņem standarta aminoskābes un B, X, Z, J, U, O un *. Mazie burti ir atļauti. Tukšās rindas ignorē; par atstarpēm, cipariem, komentāriem, jauktiem T/U un neatbalstītiem simboliem secībā ziņo ar rindu un kolonnu. Izvēles spraugas ir burtiskas - zīmes. Tā ir formāta pārbaude, nevis GenBank iesniegšanas prasību vai bioloģiskās kvalitātes novērtējums. Darbojas lokāli bez augšupielādes vai datubāzes meklēšanas. Ierobežojumi: kopā 500000 ievades rakstzīmju, 2000 ierakstu, 2000 pārbaudes problēmu, 1000 simbolu motīvs, 20000 atbilstību un 10000000 simbolu salīdzinājumu. Pārsniedzot robežu, noraida visu pārskatu. Katrs eksports ir līdz 3000000 rakstzīmēm; tipizētais CSV atļauj 200000 vērtību. Priekšskatījumā rāda 200 rindas. Apstrādi pārtrauc pēc 10 sekundēm.