מאמת FASTA
אתר רשומות FASTA פגומות וסמלי DNA, RNA או חלבונים שאינם מותרים, עם אבחון לפי שורה ועמודה.
בודק פרופיל FASTA מחמיר עם שורת כותרת אחת המתחילה בסימן >, מזהה ייחודי במילה הראשונה ורצף שאינו ריק לכל רשומה. DNA ו-RNA משתמשים באלפביתי IUPAC נפרדים. בחלבונים מתקבלות חומצות האמינו התקניות וגם B, X, Z, J, U, O ו-*. אותיות קטנות מותרות. שורות ריקות אינן נבדקות; רווחים ברצף, ספרות, הערות, ערבוב T/U וסמלים שאינם נתמכים מדווחים עם שורה ועמודה. פערים אופציונליים מסומנים בתו -. זו בדיקת פורמט, לא בדיקת דרישות הגשה ל-GenBank או איכות ביולוגית. פועל מקומית ללא העלאה או שאילתות למאגרי מידע. מגבלות: 500000 תווי קלט בסך הכול, 2000 רשומות, 2000 בעיות אימות, מוטיב באורך 1000 סמלים, 20000 התאמות ו-10000000 השוואות סמלים. חריגה ממגבלה דוחה את הדוח כולו. כל ייצוא מוגבל ל-3000000 תווים; CSV עם סוגי נתונים מאפשר 200000 ערכים. התצוגה המקדימה מציגה 200 שורות. העיבוד נפסק לאחר 10 שניות. עד 500,000 תווים. בדקו את ההגדרות לפני ההרצה.
התוצאה שלכם
מאמת FASTA
- הדבק רשומות FASTA ובחר DNA, RNA או חלבון.
- אפשר פערי יישור מילוליים רק אם הם קיימים בקלט.
- בדוק כל בעיה והורד את דוח האבחון המלא.
מה צפוי לקרות
בודק פרופיל FASTA מחמיר עם שורת כותרת אחת המתחילה בסימן >, מזהה ייחודי במילה הראשונה ורצף שאינו ריק לכל רשומה. DNA ו-RNA משתמשים באלפביתי IUPAC נפרדים. בחלבונים מתקבלות חומצות האמינו התקניות וגם B, X, Z, J, U, O ו-*. אותיות קטנות מותרות. שורות ריקות אינן נבדקות; רווחים ברצף, ספרות, הערות, ערבוב T/U וסמלים שאינם נתמכים מדווחים עם שורה ועמודה. פערים אופציונליים מסומנים בתו -. זו בדיקת פורמט, לא בדיקת דרישות הגשה ל-GenBank או איכות ביולוגית. פועל מקומית ללא העלאה או שאילתות למאגרי מידע. מגבלות: 500000 תווי קלט בסך הכול, 2000 רשומות, 2000 בעיות אימות, מוטיב באורך 1000 סמלים, 20000 התאמות ו-10000000 השוואות סמלים. חריגה ממגבלה דוחה את הדוח כולו. כל ייצוא מוגבל ל-3000000 תווים; CSV עם סוגי נתונים מאפשר 200000 ערכים. התצוגה המקדימה מציגה 200 שורות. העיבוד נפסק לאחר 10 שניות.