happytails.ai
Hrvatski

Validator FASTA

Pronađite neispravne zapise FASTA i nedopuštene simbole DNA, RNA ili proteina s dijagnostikom retka i stupca.

Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.

Vaš rezultat

Prijavite problem ili podijelite ideju.

Validator FASTA
  1. Zalijepite zapise FASTA i odaberite DNA, RNA ili protein.
  2. Omogućite doslovne praznine poravnanja samo ako ih ulaz koristi.
  3. Pregledajte svaki problem i preuzmite potpuno dijagnostičko izvješće.

Što možete očekivati

Provjerava strogi profil FASTA s jednim retkom zaglavlja koji počinje znakom >, jedinstvenim identifikatorom u prvoj riječi i nepraznom sekvencom za svaki zapis. DNA i RNA koriste odvojene abecede IUPAC. Za proteine su dopuštene standardne aminokiseline te B, X, Z, J, U, O i *. Dopuštena su mala slova. Prazni retci se zanemaruju; razmaci u sekvenci, znamenke, komentari, miješanje T/U i nepodržani simboli prijavljuju se s retkom i stupcem. Neobavezne praznine označavaju se znakom -. Ovo je provjera formata, a ne uvjeta za predaju u GenBank ili biološkog kvaliteta. Radi lokalno bez slanja podataka ili upita bazama podataka. Ograničenja: ukupno 500000 ulaznih znakova, 2000 zapisa, 2000 problema pri provjeri, motiv od 1000 simbola, 20000 podudaranja i 10000000 usporedbi simbola. Prekoračenje ograničenja odbija cijelo izvješće. Svaki izvoz je ograničen na 3000000 znakova; tipizirani CSV dopušta 200000 vrijednosti. Pregled prikazuje 200 redaka. Obrada se zaustavlja nakon 10 sekundi.