happytails.ai
Bosanski

Validator FASTA

Pronađite neispravne zapise FASTA i nedozvoljene simbole DNA, RNA ili proteina s dijagnostikom reda i kolone.

Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.

Vaš rezultat

Prijavite problem ili podijelite ideju.

Validator FASTA
  1. Zalijepite zapise FASTA i odaberite DNA, RNA ili protein.
  2. Omogućite doslovne praznine poravnanja samo ako ih ulaz koristi.
  3. Pregledajte svaki problem i preuzmite potpuni dijagnostički izvještaj.

Šta možete očekivati

Provjerava strogi profil FASTA s jednim redom zaglavlja koji počinje znakom >, jedinstvenim identifikatorom u prvoj riječi i nepraznom sekvencom za svaki zapis. DNA i RNA koriste odvojene abecede IUPAC. Za proteine su dozvoljene standardne aminokiseline te B, X, Z, J, U, O i *. Dozvoljena su mala slova. Prazni redovi se zanemaruju; razmaci u sekvenci, cifre, komentari, miješanje T/U i nepodržani simboli prijavljuju se s redom i kolonom. Neobavezne praznine označavaju se znakom -. Ovo je provjera formata, a ne uslova za predaju u GenBank ili biološkog kvaliteta. Radi lokalno bez slanja podataka ili upita bazama podataka. Ograničenja: ukupno 500000 ulaznih znakova, 2000 zapisa, 2000 problema pri provjeri, motiv od 1000 simbola, 20000 podudaranja i 10000000 poređenja simbola. Prekoračenje ograničenja odbija cijeli izvještaj. Svaki izvoz je ograničen na 3000000 znakova; tipizirani CSV dopušta 200000 vrijednosti. Pregled prikazuje 200 redova. Obrada se zaustavlja nakon 10 sekundi.