FASTA 検証ツール
不正な FASTA レコードや DNA、RNA、タンパク質の不正な記号を、行と列の診断付きで検出します。
各レコードに > で始まる一行のヘッダー、一意の先頭トークン識別子、空でない配列を必要とする厳密な FASTA 形式を検証します。DNA と RNA は別々の IUPAC 文字集合を使います。タンパク質では標準アミノ酸に加え B、X、Z、J、U、O、* を受け付けます。小文字も使用できます。空行は無視し、配列内の空白、数字、コメント、T/U の混在、未対応記号は行と列を示して報告します。任意のギャップは文字どおりの - です。これは形式検証であり、GenBank 投稿要件や生物学的品質の検査ではありません。 アップロードやデータベース検索なしでローカル実行します。上限は入力合計500000文字、2000レコード、2000検証問題、1000記号のモチーフ、20000一致、10000000回の記号比較です。上限を超えるとレポート全体を拒否します。各エクスポートは3000000文字まで、型付き CSV は200000値までです。プレビューは200行です。処理は10秒で停止します。 最大500,000文字。 実行前に設定を確認してください。
処理結果
FASTA 検証ツール
- FASTA レコードを貼り付け、DNA、RNA、タンパク質を選択します。
- 入力で使用している場合のみ、文字どおりのアラインメントギャップを有効にします。
- すべての問題を確認し、完全な診断レポートをダウンロードします。
できること・制限
各レコードに > で始まる一行のヘッダー、一意の先頭トークン識別子、空でない配列を必要とする厳密な FASTA 形式を検証します。DNA と RNA は別々の IUPAC 文字集合を使います。タンパク質では標準アミノ酸に加え B、X、Z、J、U、O、* を受け付けます。小文字も使用できます。空行は無視し、配列内の空白、数字、コメント、T/U の混在、未対応記号は行と列を示して報告します。任意のギャップは文字どおりの - です。これは形式検証であり、GenBank 投稿要件や生物学的品質の検査ではありません。 アップロードやデータベース検索なしでローカル実行します。上限は入力合計500000文字、2000レコード、2000検証問題、1000記号のモチーフ、20000一致、10000000回の記号比較です。上限を超えるとレポート全体を拒否します。各エクスポートは3000000文字まで、型付き CSV は200000値までです。プレビューは200行です。処理は10秒で停止します。