FASTA-ellenőrző
Keresse meg a hibás FASTA-rekordokat és érvénytelen DNA-, RNA- vagy fehérjeszimbólumokat sor- és oszlopdiagnosztikával.
Checks a strict FASTA profile with one header line beginning with >, a unique first-token identifier and a nonempty sequence for each record. DNA and RNA use separate IUPAC alphabets. Protein accepts the standard amino acids plus B, X, Z, J, U, O and *. Lowercase is accepted. Empty lines are ignored; sequence whitespace, digits, comments, mixed T/U and unsupported symbols are reported with line and column. Optional gaps are literal -. This is format validation, not a GenBank submission check or biological quality assessment. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.
Az eredményed
FASTA-ellenőrző
- Illesszen be FASTA-rekordokat, és válasszon DNA-t, RNA-t vagy fehérjét.
- Csak akkor engedélyezze a szó szerinti illesztési hézagokat, ha a bemenet használja őket.
- Tekintsen át minden hibát, és töltse le a teljes diagnosztikai jelentést.
Mire számíthatsz
Szigorú FASTA-formátumot ellenőriz: minden rekordhoz egy > jellel kezdődő fejlécsor, egyedi első tokenből álló azonosító és nem üres szekvencia szükséges. A DNA és az RNA külön IUPAC-ábécét használ. Fehérjéknél a szokásos aminosavak mellett B, X, Z, J, U, O és * is elfogadott. A kisbetűk megengedettek. Az üres sorokat figyelmen kívül hagyja; a szekvencia szóközeit, számjegyeit, megjegyzéseit, kevert T/U jeleit és nem támogatott szimbólumait sorral és oszloppal jelzi. Az opcionális hézagok szó szerinti - jelek. Ez formátumellenőrzés, nem GenBank-beküldési vagy biológiai minőségvizsgálat. Helyben fut, feltöltés és adatbázis-lekérdezés nélkül. Korlátok: összesen 500000 bemeneti karakter, 2000 rekord, 2000 ellenőrzési hiba, 1000 szimbólumos motívum, 20000 találat és 10000000 szimbólum-összehasonlítás. Bármely korlát túllépése elutasítja a teljes jelentést. Egy export legfeljebb 3000000 karakter; a típusozott CSV 200000 értéket enged. Az előnézet 200 sort mutat. A feldolgozás 10 másodperc után leáll.