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配列の逆相補

すべての IUPAC 曖昧性記号を用いて DNA または RNA の FASTA 逆相補配列を作成し、元の大文字小文字とヘッダーを保持します。

完全な IUPAC DNA または RNA 曖昧性文字集合を用いて、各 FASTA レコードの逆相補配列を作成します。DNA は A/T、RNA は A/U の組を使います。大文字小文字と任意の - ギャップを保持し、ギャップも配列とともに反転します。元の識別子と完全なヘッダーを保持します。ヘッダー注釈や生物学的特徴の座標は書き換えません。タンパク質への翻訳や生物学的な鎖の推定は行いません。 アップロードやデータベース検索なしでローカル実行します。上限は入力合計500000文字、2000レコード、2000検証問題、1000記号のモチーフ、20000一致、10000000回の記号比較です。上限を超えるとレポート全体を拒否します。各エクスポートは3000000文字まで、型付き CSV は200000値までです。プレビューは200行です。処理は10秒で停止します。 最大500,000文字。 実行前に設定を確認してください。

処理結果

問題を報告したり、アイデアを共有したりできます。

配列の逆相補
  1. FASTA を貼り付け、DNA または RNA を選択します。
  2. アラインメント済み入力の場合のみ、文字どおりのギャップを有効にします。
  3. 配列長を確認し、逆相補 FASTA とレポートをダウンロードします。

できること・制限

完全な IUPAC DNA または RNA 曖昧性文字集合を用いて、各 FASTA レコードの逆相補配列を作成します。DNA は A/T、RNA は A/U の組を使います。大文字小文字と任意の - ギャップを保持し、ギャップも配列とともに反転します。元の識別子と完全なヘッダーを保持します。ヘッダー注釈や生物学的特徴の座標は書き換えません。タンパク質への翻訳や生物学的な鎖の推定は行いません。 アップロードやデータベース検索なしでローカル実行します。上限は入力合計500000文字、2000レコード、2000検証問題、1000記号のモチーフ、20000一致、10000000回の記号比較です。上限を超えるとレポート全体を拒否します。各エクスポートは3000000文字まで、型付き CSV は200000値までです。プレビューは200行です。処理は10秒で停止します。

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