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Umgekehrtes Sequenzkomplement

DNA- oder RNA-FASTA mit sämtlichen IUPAC-Mehrdeutigkeitssymbolen umgekehrt komplementieren und Schreibweise sowie Kopfzeilen erhalten.

Bildet das umgekehrte Komplement jedes FASTA-Eintrags mit dem vollständigen IUPAC-Mehrdeutigkeitsalphabet für DNA oder RNA. DNA nutzt A/T, RNA A/U. Groß-/Kleinschreibung und optionale - Lücken bleiben erhalten; Lücken werden ebenfalls umgekehrt. Kennungen und vollständige Kopfzeilen bleiben erhalten. Annotationen und biologische Koordinaten werden nicht umgeschrieben. Dies übersetzt keine Proteine und leitet keinen biologischen Strang ab. Läuft lokal ohne Upload oder Datenbankabfrage. Grenzen: insgesamt 500000 Eingabezeichen, 2000 Einträge, 2000 Validierungsprobleme, Motiv mit 1000 Symbolen, 20000 Treffer und 10000000 Symbolvergleiche. Grenzverletzung verwirft den gesamten Bericht. Jeder Export höchstens 3000000 Zeichen; typisierte CSV höchstens 200000 Werte. Vorschau mit 200 Zeilen. Verarbeitung endet nach 10 Sekunden. Bis zu 500.000 Zeichen. Prüfe die Einstellungen vor dem Start.

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Umgekehrtes Sequenzkomplement
  1. FASTA einfügen und DNA oder RNA wählen.
  2. Wörtliche Lücken nur bei ausgerichteter Eingabe erlauben.
  3. Sequenzlängen prüfen und umgekehrt komplementierte FASTA samt Bericht herunterladen.

Was du wissen solltest

Bildet das umgekehrte Komplement jedes FASTA-Eintrags mit dem vollständigen IUPAC-Mehrdeutigkeitsalphabet für DNA oder RNA. DNA nutzt A/T, RNA A/U. Groß-/Kleinschreibung und optionale - Lücken bleiben erhalten; Lücken werden ebenfalls umgekehrt. Kennungen und vollständige Kopfzeilen bleiben erhalten. Annotationen und biologische Koordinaten werden nicht umgeschrieben. Dies übersetzt keine Proteine und leitet keinen biologischen Strang ab. Läuft lokal ohne Upload oder Datenbankabfrage. Grenzen: insgesamt 500000 Eingabezeichen, 2000 Einträge, 2000 Validierungsprobleme, Motiv mit 1000 Symbolen, 20000 Treffer und 10000000 Symbolvergleiche. Grenzverletzung verwirft den gesamten Bericht. Jeder Export höchstens 3000000 Zeichen; typisierte CSV höchstens 200000 Werte. Vorschau mit 200 Zeilen. Verarbeitung endet nach 10 Sekunden.

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