Extraktor sekvencí FASTA
Vyberte přesné identifikátory FASTA a volitelné rozsahy včetně krajních bodů při zachování hlaviček a velikosti písmen sekvencí.
Vybere celé záznamy FASTA podle přesného identifikátoru nebo z každého vybraného záznamu vyjme stejný rozsah souřadnic. Souřadnice začínají jedničkou a zahrnují oba krajní body. Rozsahy nemohou přecházet přes konec záznamu ani překročit jeho hranice. Mezery zarovnání se počítají jako pozice. Výstup zachová původní identifikátor, celou hlavičku a velikost písmen sekvence; souřadnice se zapisují odděleně do JSON a CSV. Existující anotace v hlavičce se po vyjmutí nepřepočítávají. Běží místně bez odesílání nebo dotazů do databází. Limity: celkem 500000 vstupních znaků, 2000 záznamů, 2000 problémů při kontrole, motiv o 1000 symbolech, 20000 shod a 10000000 porovnání symbolů. Překročení limitu odmítne celou zprávu. Každý export je omezen na 3000000 znaků; typovaný CSV dovoluje 200000 hodnot. Náhled zobrazuje 200 řádků. Zpracování se zastaví po 10 sekundách. Nejvýše 500 000 znaků. Před spuštěním zkontrolujte nastavení.
Váš výsledek
Extraktor sekvencí FASTA
- Vložte platný FASTA a vyberte jeho abecedu.
- Uveďte přesné identifikátory v požadovaném pořadí a případně zadejte obě souřadnice.
- Prohlédněte vybrané délky a stáhněte sekvence FASTA i úplnou zprávu.
Co očekávat
Vybere celé záznamy FASTA podle přesného identifikátoru nebo z každého vybraného záznamu vyjme stejný rozsah souřadnic. Souřadnice začínají jedničkou a zahrnují oba krajní body. Rozsahy nemohou přecházet přes konec záznamu ani překročit jeho hranice. Mezery zarovnání se počítají jako pozice. Výstup zachová původní identifikátor, celou hlavičku a velikost písmen sekvence; souřadnice se zapisují odděleně do JSON a CSV. Existující anotace v hlavičce se po vyjmutí nepřepočítávají. Běží místně bez odesílání nebo dotazů do databází. Limity: celkem 500000 vstupních znaků, 2000 záznamů, 2000 problémů při kontrole, motiv o 1000 symbolech, 20000 shod a 10000000 porovnání symbolů. Překročení limitu odmítne celou zprávu. Každý export je omezen na 3000000 znaků; typovaný CSV dovoluje 200000 hodnot. Náhled zobrazuje 200 řádků. Zpracování se zastaví po 10 sekundách.