FASTA-sekvenssien poimija
Valitse täsmälliset FASTA-tunnisteet ja valinnaiset päätepisteet sisältävät välit säilyttäen otsakkeet ja kirjainkoko.
Select complete FASTA records by exact identifier or extract the same one-based inclusive coordinate range from each selected record. Ranges cannot wrap or run beyond record boundaries. Alignment gaps count as positions. Output preserves the original identifier, full header and sequence case, with coordinates recorded separately in JSON and CSV. Existing annotations in a header are not recalculated after extraction. Runs locally without uploads or database lookup. Limit: 500000 combined input characters, 2000 records, 2000 validation issues, a 1000-symbol motif, 20000 matches and 10000000 symbol comparisons. Exceeding a limit rejects the complete report. Each export is limited to 3000000 characters; typed CSV allows 200000 values. Preview shows 200 rows. Processing stops after 10 seconds. Up to 500,000 characters. Review the settings before running.
Tuloksesi
FASTA-sekvenssien poimija
- Liitä kelvollinen FASTA ja valitse sen aakkosto.
- Luettele täsmälliset tunnisteet halutussa järjestyksessä ja anna halutessasi molemmat koordinaatit.
- Tarkista valitut pituudet ja lataa FASTA-sekvenssit sekä koko raportti.
Mitä on hyvä tietää
Valitse kokonaiset FASTA-tietueet täsmällisellä tunnisteella tai poimi jokaisesta valitusta tietueesta sama yhdestä alkava, päätepisteet sisältävä koordinaattiväli. Väli ei saa kiertää eikä ylittää tietueen rajoja. Kohdistusaukot lasketaan sijainneiksi. Alkuperäinen tunniste, koko otsake ja kirjainkoko säilyvät; koordinaatit tallennetaan erikseen JSON- ja CSV-tiedostoihin. Otsakkeen annotaatioita ei lasketa uudelleen poiminnan jälkeen. Toimii paikallisesti ilman lähetyksiä tai tietokantahakuja. Rajat: yhteensä 500000 syötemerkkiä, 2000 tietuetta, 2000 tarkistusvirhettä, 1000 symbolin motiivi, 20000 osumaa ja 10000000 symbolivertailua. Rajan ylitys hylkää koko raportin. Kukin vienti on enintään 3000000 merkkiä; tyypitetty CSV sallii 200000 arvoa. Esikatselu näyttää 200 riviä. Käsittely pysähtyy 10 sekunnin jälkeen.